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Soutenance de thèse

Méthodes d'analyses protéomiques quantitatives pour la découverte et validation de biomarqueurs circulants : application aux maladies hépatiques

​​​Jeudi 19 octobre 20​23 à 14:00 - CEA Grenoble, 17 avenue des Martyrs, 38000 Grenoble - salle Clinatec
Publié le 19 octobre 2023

​Par David Perez Compte​
Équipe Étude de la Dynamique des Protéomes (EDyP)

L’objectif était de développer et mettre en application des méthodes de quantification de protéines. Premièrement, des biomarqueurs plasmatiques pour la fibrose ont été découverts et validés chez des patients atteints de MASLD, une maladie hépatique métabolique touchant 25 % de la population mondiale et dont le test diagnostic de référence possède de nombreux inconvénients. L‘ALS et la LG3BP ont été validés sur deux cohortes indépendantes puis ont été introduites dans un panel basé sur le FibroTest. Le deuxième projet consistait à optimiser les quantifications absolues en LC-MS basées sur l’utilisation de standards isotopiquement alourdis (PSAQ). L’originalité du PSAQ+1 consistait à introduire une protéine assimilée à la protéine endogène qui contient uniquement un 13C dans les arginines et lysines avant une analyse LC-MS/MS. Les résultats ont montré qu’une seule fenêtre de masse est nécessaire pour quantifier la protéine légère et marquée. Cette technique pourrait apporter plus de spécificité, sensibilité et précision lors des quantifications absolues par LC-MS/MS utilisant des standards isotopiques.​