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Plate-forme CMBA

Publié le 17 janvier 2023
  


Le CMBA : membre de l’infrastructure nationale CHEMBIOFRANCE
La plate-forme de criblage pour des molécules bioactives (CMBA) du laboratoire BGE participe à l’infrastructure nationale ChemBioFrance. Cette infrastructure a été conçue pour favoriser et dynamiser les échanges et les services aux interfaces de la chimie de la biologie et de la chémoinformatique afin de sélectionner des molécules bioactives utilisables à des fins de recherche fondamentale ou thérapeutique. ChemBioFrance est une infrastructure distribuée qui interconnecte la chimiothèque nationale, les plate-formes de criblage et d’études pharmacocinétiques (ADME), et des laboratoires de modélisation moléculaire (chemoinformatique). Elle est ouverte aux chercheurs des laboratoires académiques et privés.
Contact CEA/DRF/Irig : Marie-Odile Fauvarque
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Le CMBA fait également partie du GDR CNRS ChemBio dont la mission principale est de fédérer les équipes françaises travaillant en chémobiologie à l’échelle nationale.

La plate-forme CMBA travaille en étroite collaboration avec la plate-forme DPM-Expert du département de pharmacologie moléculaire (DPM) de l'Université Grenoble Alpes, dirigé par le professeur Yung-Sing Wong. La plate-forme DPM-expert fournit une expertise en chimie médicinale et des collections de produits chimiques originaux, notamment extraits de la flore alpine. Ensemble, les deux plateformes constitue le consortium Grenoble Alpes Drug Discovery (GAP2D), labélisé par le GIS-IBiSA gage d'accès ouvert, et de fiabilité pour l’acquisition, l'analyse et le stockage de données.

Le CMBA a été spécialement conçu pour réaliser des cribles phénotypiques, c’est-à-dire des cribles qui utilisent des tests sur cellules vivantes basés sur la quantification de signaux d’absorbance, de fluorescence ou de luminescence (HTS), ou sur l'acquisition et l'analyse automatisées d'images en microscopie de fluorescence (HCS/HCA High Content Screening /High Content Analysis). Ce type de cribles offre un double intérêt : d’une part la sélection de composés actifs dans le contexte cellulaire, et d’autre part une meilleure caractérisation fonctionnelle de la fonction de protéines, sans a priori sur leur identité. En plus de son expertise dans le domaine des tests cellulaires, le CMBA possède le savoir-faire nécessaire à la mise en œuvre de tests biochimiques divers sur des protéines d’intérêt ou des cibles thérapeutiques purifiées. Ces stratégies in vitro mènent à la sélection de molécules ciblant une protéine d’intérêt, connue pour son rôle dans un processus biologique étudié ou une pathologie.



Le CMBA est très largement ouvert à la communauté scientifique. Ainsi, depuis 2009, plus de 30 criblages ont été réalisés avec 25 partenaires académiques ou privés. Tous les domaines d’application en biologie, santé, bioénergie et environnement sont concernés, avec d’ores et déjà des molécules sélectionnées pour leur potentiel dans le traitement du cancer, des maladies infectieuses, ou dans la production de bio-carburant de 3ème génération.
Le CMBA accompagne les scientifiques dans l’évaluation de la faisabilité d’un projet de crible, les assiste dans les étapes de miniaturisation des tests « de paillasse » en microplaques, et procède ensuite à l’automatisation du test puis au crible pilote d’une banque de molécules chimiques de petite ou moyenne envergure. Le crible pilote apporte la preuve de concept de la pertinence du test biologique, de sa robustesse statistique et de sa maniabilité sur une plate-forme automatisée. Un crible de plus grande envergure est ensuite réalisé.