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Ricky Bhajun

Une approche réseau pour l’inférence du rôle des microARN dans la corégulation des processus biologiques

Publié le 8 octobre 2015
Thèse soutenue le 08 octobre 2015 pour obtenir le grade de Docteur de l'Université Grenoble Alpes - Spécialité : Bioinformatique

Résumé :
Les microARN (miARN) sont des entités qui régulent les gènes dans nos cellules. Comme un miARN est capable d’intervenir auprès d’une centaine de gènes différents et que chaque gène est susceptible d’être régulé par un ensemble de miARN, il existe un réseau très complexe de co-régulation où les miARN et les gènes interagissent de concert pour fournir le phénotype des cellules. L’objectif de cette thèse était d’étudier ce réseau de co-régulation en utilisant un ensemble d’outils issus de la théorie des graphes pour avoir une meilleure vision du rôle des miARN. Plus concrètement, le projet a consisté en l’inférence d’un réseau basé sur le partage de gènes entre miARN puis son analyse aussi bien globalement (i.e. forme du graphe et interprétation biologique) que localement (i.e. trouver des communautés et prédire leurs rôles). Ces travaux ont ainsi permis de mettre en évidence des groupes de miARN impliqués dans différents processus comme la signalisation ou encore le développement.

Jury :
Pr Denis Thieffry
Dr Pascal Barbry
Pr Daniel Gautheret
Dr Xavier Gidrol
Dr Christian Lajaunie
Dr Laurent Guyon
Directeur de thèse : Dr Xavier Gidrol
Co-directeur de thèse : Dr Christian Lajaunie et
Co-encadrant : Dr Laurent Guyon

Mots-clés :
microARN, ARN interférence, miARN, corégulation

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