Vous êtes ici : Accueil > Le GIPSE > Logiciels développés au GIPSE > Seq3A : Gestion d’une plateforme de séquençage de protéines

Seq3A : Gestion d’une plateforme de séquençage de protéines

Publié le 5 février 2019



Laboratoire impliqué
Plate-forme de séquençage et d'analyse d'acides aminés de l'Institut de Biologie Structurale (ISBG).
Contexte scientifique
La plateforme de séquençage et d'analyse d'acides aminés traite environ 500 échantillons l'an pour sa partie « Séquençage » et environ 350 pour la partie « Analyse ».

Elle est chargée de traiter les échantillons de la communauté scientifique, quelque soit leur origine, ainsi que toute demande émanant du secteur industriel.
Description du projet
Le projet a consisté à refondre le logiciel de gestion de la plateforme.

Ce logiciel permet de tracer :
- tout échantillon arrivant à la plateforme
- l'objet de la demande : but poursuivi, résultats attendus …
- le protocole appliqué au traitement de l'échantillon
- l'identification et les références des lots de réactifs utilisés
- les résultats obtenus, commentaires divers…en vue d'établir le compte rendu remis au client.

Il permet également l'exploitation de toutes ces données afin d'en tirer des statistiques.
Technologies utilisées
Application web développée avec Java (GWT, Spring, JPA, AspectJ, JUnit), PostgreSQL.
Interview d'octobre 2014 de Jean-Pierre Andrieu
Que vous apporte le logiciel dans votre travail ?
J'utilise quotidiennement Seq3A : il me permet de relier un client à un échantillon, à un protocole et aux résultats obtenus pour cet échantillon. Seq3A me permet de consulter tout mon travail depuis février 1995, date de mon arrivée à l'IBS.

Pourquoi avoir fait appel au GIPSE ?
Un collègue informaticien m'avait signalé l'existence du GIPSE et m'avait indiqué que cette équipe pouvait déveloper un logiciel répondant à mes besoins.

Comment s'est passée la collaboration avec le GIPSE ?
Très bien et le plus simplement du monde.